Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
TCIRG1Q13488 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TCIRG1Q13488 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TCIRG1Q13488 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TCIRG1Q13488 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
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