Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD4Q13485 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD4Q13485 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD4Q13485 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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