Protein–RNA interactions for Protein: Q12893

TMEM115, Transmembrane protein 115, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM115Q12893 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM115Q12893 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM115Q12893 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM115Q12893 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM115Q12893 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM115Q12893 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM115Q12893 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM115Q12893 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM115Q12893 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM115Q12893 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM115Q12893 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM115Q12893 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM115Q12893 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM115Q12893 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM115Q12893 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM115Q12893 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM115Q12893 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM115Q12893 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM115Q12893 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM115Q12893 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM115Q12893 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM115Q12893 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM115Q12893 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM115Q12893 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM115Q12893 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM115Q12893 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM115Q12893 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM115Q12893 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms