Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SREBF2Q12772 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SREBF2Q12772 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SREBF2Q12772 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SREBF2Q12772 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms