Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX4Q06945 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SOX4Q06945 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms