Protein–RNA interactions for Protein: Q06413

MEF2C, Myocyte-specific enhancer factor 2C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEF2CQ06413 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEF2CQ06413 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MEF2CQ06413 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEF2CQ06413 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms