Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSBP1Q04837 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSBP1Q04837 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms