Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BDH1Q02338 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BDH1Q02338 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms