Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBX1P62877 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBX1P62877 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBX1P62877 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBX1P62877 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBX1P62877 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBX1P62877 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBX1P62877 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBX1P62877 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RBX1P62877 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RBX1P62877 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBX1P62877 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBX1P62877 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBX1P62877 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBX1P62877 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBX1P62877 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RBX1P62877 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBX1P62877 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBX1P62877 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBX1P62877 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBX1P62877 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBX1P62877 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBX1P62877 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBX1P62877 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBX1P62877 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBX1P62877 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBX1P62877 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBX1P62877 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBX1P62877 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBX1P62877 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBX1P62877 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBX1P62877 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBX1P62877 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBX1P62877 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBX1P62877 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBX1P62877 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBX1P62877 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RBX1P62877 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBX1P62877 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBX1P62877 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBX1P62877 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RBX1P62877 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBX1P62877 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RBX1P62877 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBX1P62877 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RBX1P62877 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBX1P62877 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBX1P62877 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBX1P62877 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBX1P62877 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBX1P62877 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBX1P62877 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RBX1P62877 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBX1P62877 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBX1P62877 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBX1P62877 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBX1P62877 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBX1P62877 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBX1P62877 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBX1P62877 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBX1P62877 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBX1P62877 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RBX1P62877 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBX1P62877 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBX1P62877 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBX1P62877 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RBX1P62877 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBX1P62877 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBX1P62877 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBX1P62877 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBX1P62877 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RBX1P62877 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RBX1P62877 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RBX1P62877 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBX1P62877 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBX1P62877 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBX1P62877 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBX1P62877 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBX1P62877 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBX1P62877 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBX1P62877 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBX1P62877 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBX1P62877 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBX1P62877 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBX1P62877 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBX1P62877 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBX1P62877 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBX1P62877 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBX1P62877 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBX1P62877 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBX1P62877 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBX1P62877 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBX1P62877 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBX1P62877 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBX1P62877 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RBX1P62877 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBX1P62877 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBX1P62877 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBX1P62877 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBX1P62877 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms