Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL23AP62750 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms