Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RWDD2BP57060 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RWDD2BP57060 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.5 ms