Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP6P55212 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP6P55212 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP6P55212 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP6P55212 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP6P55212 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP6P55212 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP6P55212 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP6P55212 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP6P55212 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP6P55212 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP6P55212 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP6P55212 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP6P55212 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP6P55212 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP6P55212 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP6P55212 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP6P55212 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP6P55212 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP6P55212 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP6P55212 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP6P55212 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP6P55212 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP6P55212 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP6P55212 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP6P55212 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP6P55212 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP6P55212 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP6P55212 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP6P55212 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP6P55212 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP6P55212 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP6P55212 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP6P55212 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP6P55212 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP6P55212 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP6P55212 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP6P55212 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP6P55212 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP6P55212 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP6P55212 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP6P55212 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP6P55212 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP6P55212 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP6P55212 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP6P55212 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP6P55212 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP6P55212 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP6P55212 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP6P55212 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP6P55212 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP6P55212 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP6P55212 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP6P55212 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP6P55212 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP6P55212 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP6P55212 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP6P55212 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP6P55212 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP6P55212 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP6P55212 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP6P55212 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP6P55212 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP6P55212 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP6P55212 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP6P55212 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP6P55212 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP6P55212 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP6P55212 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP6P55212 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP6P55212 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP6P55212 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP6P55212 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP6P55212 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP6P55212 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP6P55212 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP6P55212 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP6P55212 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP6P55212 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP6P55212 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP6P55212 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP6P55212 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP6P55212 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP6P55212 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP6P55212 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP6P55212 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP6P55212 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASP6P55212 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP6P55212 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP6P55212 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP6P55212 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP6P55212 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP6P55212 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP6P55212 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP6P55212 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP6P55212 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP6P55212 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP6P55212 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP6P55212 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP6P55212 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.7 ms