Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
AFDNP55196 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
AFDNP55196 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
AFDNP55196 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
AFDNP55196 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
AFDNP55196 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
AFDNP55196 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
AFDNP55196 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
AFDNP55196 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
AFDNP55196 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
AFDNP55196 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
AFDNP55196 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
AFDNP55196 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
AFDNP55196 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
AFDNP55196 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
AFDNP55196 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
AFDNP55196 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
AFDNP55196 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
AFDNP55196 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
AFDNP55196 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
AFDNP55196 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
AFDNP55196 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
AFDNP55196 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
AFDNP55196 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
AFDNP55196 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
AFDNP55196 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
AFDNP55196 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
AFDNP55196 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
AFDNP55196 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
AFDNP55196 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
AFDNP55196 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
AFDNP55196 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
AFDNP55196 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
AFDNP55196 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
AFDNP55196 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
AFDNP55196 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
AFDNP55196 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
AFDNP55196 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
AFDNP55196 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
AFDNP55196 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
AFDNP55196 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
AFDNP55196 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
AFDNP55196 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
AFDNP55196 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
AFDNP55196 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
AFDNP55196 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
AFDNP55196 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
AFDNP55196 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
AFDNP55196 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
AFDNP55196 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
AFDNP55196 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
AFDNP55196 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
AFDNP55196 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
AFDNP55196 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
AFDNP55196 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
AFDNP55196 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
AFDNP55196 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
AFDNP55196 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
AFDNP55196 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
AFDNP55196 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
AFDNP55196 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
AFDNP55196 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
AFDNP55196 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
AFDNP55196 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
AFDNP55196 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
AFDNP55196 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
AFDNP55196 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AFDNP55196 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AFDNP55196 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
AFDNP55196 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AFDNP55196 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
AFDNP55196 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
AFDNP55196 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
AFDNP55196 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
AFDNP55196 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
AFDNP55196 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
AFDNP55196 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
AFDNP55196 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
AFDNP55196 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
AFDNP55196 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
AFDNP55196 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
AFDNP55196 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
AFDNP55196 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
AFDNP55196 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
AFDNP55196 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
AFDNP55196 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
AFDNP55196 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
AFDNP55196 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
AFDNP55196 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
AFDNP55196 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AFDNP55196 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
AFDNP55196 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
AFDNP55196 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AFDNP55196 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AFDNP55196 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AFDNP55196 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AFDNP55196 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AFDNP55196 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AFDNP55196 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
AFDNP55196 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms