Protein–RNA interactions for Protein: P55089

UCN, Urocortin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCNP55089 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCNP55089 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCNP55089 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UCNP55089 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCNP55089 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCNP55089 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCNP55089 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UCNP55089 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCNP55089 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCNP55089 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCNP55089 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCNP55089 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UCNP55089 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCNP55089 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCNP55089 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCNP55089 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UCNP55089 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCNP55089 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCNP55089 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCNP55089 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCNP55089 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCNP55089 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCNP55089 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCNP55089 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCNP55089 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCNP55089 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UCNP55089 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCNP55089 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCNP55089 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCNP55089 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UCNP55089 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCNP55089 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCNP55089 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCNP55089 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UCNP55089 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCNP55089 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCNP55089 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCNP55089 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UCNP55089 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCNP55089 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCNP55089 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCNP55089 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UCNP55089 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCNP55089 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UCNP55089 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UCNP55089 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UCNP55089 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UCNP55089 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCNP55089 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCNP55089 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCNP55089 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UCNP55089 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCNP55089 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCNP55089 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCNP55089 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCNP55089 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCNP55089 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UCNP55089 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCNP55089 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCNP55089 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCNP55089 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCNP55089 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCNP55089 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UCNP55089 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCNP55089 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCNP55089 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCNP55089 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCNP55089 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCNP55089 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UCNP55089 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCNP55089 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCNP55089 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCNP55089 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UCNP55089 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCNP55089 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCNP55089 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UCNP55089 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCNP55089 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UCNP55089 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UCNP55089 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UCNP55089 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UCNP55089 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCNP55089 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCNP55089 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCNP55089 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCNP55089 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UCNP55089 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCNP55089 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCNP55089 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCNP55089 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UCNP55089 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCNP55089 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCNP55089 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCNP55089 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCNP55089 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCNP55089 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCNP55089 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCNP55089 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCNP55089 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UCNP55089 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms