Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATN1P54259 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATN1P54259 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATN1P54259 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATN1P54259 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATN1P54259 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATN1P54259 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATN1P54259 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATN1P54259 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATN1P54259 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATN1P54259 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATN1P54259 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATN1P54259 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATN1P54259 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATN1P54259 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATN1P54259 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATN1P54259 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATN1P54259 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATN1P54259 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATN1P54259 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATN1P54259 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATN1P54259 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATN1P54259 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATN1P54259 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATN1P54259 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATN1P54259 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATN1P54259 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATN1P54259 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATN1P54259 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATN1P54259 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATN1P54259 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATN1P54259 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATN1P54259 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATN1P54259 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATN1P54259 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATN1P54259 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATN1P54259 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATN1P54259 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATN1P54259 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATN1P54259 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATN1P54259 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATN1P54259 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATN1P54259 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATN1P54259 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATN1P54259 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATN1P54259 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATN1P54259 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATN1P54259 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATN1P54259 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATN1P54259 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATN1P54259 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATN1P54259 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATN1P54259 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATN1P54259 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATN1P54259 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATN1P54259 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATN1P54259 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATN1P54259 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATN1P54259 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATN1P54259 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATN1P54259 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATN1P54259 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATN1P54259 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATN1P54259 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATN1P54259 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATN1P54259 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATN1P54259 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATN1P54259 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATN1P54259 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATN1P54259 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATN1P54259 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATN1P54259 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATN1P54259 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATN1P54259 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATN1P54259 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATN1P54259 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATN1P54259 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATN1P54259 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATN1P54259 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATN1P54259 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATN1P54259 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATN1P54259 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATN1P54259 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATN1P54259 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATN1P54259 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATN1P54259 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATN1P54259 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATN1P54259 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATN1P54259 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATN1P54259 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATN1P54259 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATN1P54259 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATN1P54259 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATN1P54259 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATN1P54259 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATN1P54259 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATN1P54259 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATN1P54259 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATN1P54259 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATN1P54259 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms