Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VEGFBP49765 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VEGFBP49765 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
VEGFBP49765 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms