Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSOP43234 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSOP43234 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSOP43234 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSOP43234 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTSOP43234 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSOP43234 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSOP43234 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSOP43234 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSOP43234 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTSOP43234 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSOP43234 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTSOP43234 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTSOP43234 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSOP43234 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSOP43234 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSOP43234 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSOP43234 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSOP43234 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSOP43234 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSOP43234 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTSOP43234 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTSOP43234 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTSOP43234 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTSOP43234 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTSOP43234 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTSOP43234 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTSOP43234 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTSOP43234 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSOP43234 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSOP43234 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSOP43234 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSOP43234 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSOP43234 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSOP43234 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSOP43234 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSOP43234 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSOP43234 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSOP43234 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSOP43234 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSOP43234 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSOP43234 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSOP43234 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSOP43234 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSOP43234 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSOP43234 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSOP43234 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSOP43234 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSOP43234 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSOP43234 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSOP43234 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSOP43234 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSOP43234 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSOP43234 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSOP43234 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSOP43234 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTSOP43234 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTSOP43234 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSOP43234 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSOP43234 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSOP43234 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSOP43234 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSOP43234 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTSOP43234 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTSOP43234 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTSOP43234 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTSOP43234 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTSOP43234 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTSOP43234 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTSOP43234 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTSOP43234 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTSOP43234 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTSOP43234 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTSOP43234 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTSOP43234 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTSOP43234 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTSOP43234 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTSOP43234 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTSOP43234 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTSOP43234 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTSOP43234 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTSOP43234 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTSOP43234 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTSOP43234 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTSOP43234 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSOP43234 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSOP43234 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms