Protein–RNA interactions for Protein: P41235

HNF4A, Hepatocyte nuclear factor 4-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4AP41235 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNF4AP41235 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HNF4AP41235 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNF4AP41235 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms