Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK1P39086 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIK1P39086 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms