Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP7BP35670 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP7BP35670 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ATP7BP35670 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ATP7BP35670 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ATP7BP35670 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ATP7BP35670 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ATP7BP35670 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ATP7BP35670 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ATP7BP35670 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ATP7BP35670 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATP7BP35670 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ATP7BP35670 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ATP7BP35670 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ATP7BP35670 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATP7BP35670 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ATP7BP35670 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7BP35670 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ATP7BP35670 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7BP35670 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7BP35670 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7BP35670 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7BP35670 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7BP35670 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7BP35670 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ATP7BP35670 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ATP7BP35670 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ATP7BP35670 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ATP7BP35670 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ATP7BP35670 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ATP7BP35670 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms