Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCD1P33897 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCD1P33897 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCD1P33897 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCD1P33897 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms