Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A4P31645 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms