Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRM2P31350 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRM2P31350 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRM2P31350 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRM2P31350 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRM2P31350 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRM2P31350 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRM2P31350 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RRM2P31350 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RRM2P31350 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRM2P31350 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRM2P31350 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RRM2P31350 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRM2P31350 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRM2P31350 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM2P31350 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM2P31350 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM2P31350 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM2P31350 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM2P31350 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM2P31350 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2P31350 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2P31350 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2P31350 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2P31350 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2P31350 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2P31350 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2P31350 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2P31350 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM2P31350 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM2P31350 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM2P31350 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM2P31350 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM2P31350 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM2P31350 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM2P31350 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM2P31350 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM2P31350 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM2P31350 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM2P31350 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM2P31350 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM2P31350 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM2P31350 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM2P31350 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM2P31350 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM2P31350 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM2P31350 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM2P31350 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM2P31350 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM2P31350 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM2P31350 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM2P31350 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM2P31350 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM2P31350 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM2P31350 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM2P31350 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM2P31350 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM2P31350 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM2P31350 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM2P31350 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM2P31350 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM2P31350 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM2P31350 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM2P31350 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM2P31350 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM2P31350 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM2P31350 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM2P31350 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM2P31350 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM2P31350 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM2P31350 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM2P31350 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM2P31350 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM2P31350 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM2P31350 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM2P31350 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM2P31350 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM2P31350 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM2P31350 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM2P31350 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRM2P31350 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM2P31350 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM2P31350 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM2P31350 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRM2P31350 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM2P31350 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM2P31350 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM2P31350 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM2P31350 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM2P31350 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM2P31350 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRM2P31350 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRM2P31350 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRM2P31350 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRM2P31350 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRM2P31350 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRM2P31350 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRM2P31350 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRM2P31350 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRM2P31350 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms