Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA9P31269 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA9P31269 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 542.6 ms