Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CXCL3P19876 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL3P19876 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL3P19876 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms