Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERCC3P19447 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC3P19447 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC3P19447 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC3P19447 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC3P19447 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms