Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VCAM1P19320 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VCAM1P19320 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VCAM1P19320 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VCAM1P19320 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms