Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL17P18621 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPL17P18621 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPL17P18621 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL17P18621 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPL17P18621 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL17P18621 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL17P18621 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL17P18621 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL17P18621 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL17P18621 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL17P18621 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL17P18621 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL17P18621 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL17P18621 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL17P18621 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL17P18621 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL17P18621 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL17P18621 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL17P18621 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL17P18621 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL17P18621 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL17P18621 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL17P18621 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL17P18621 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL17P18621 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL17P18621 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL17P18621 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL17P18621 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL17P18621 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL17P18621 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL17P18621 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL17P18621 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL17P18621 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL17P18621 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL17P18621 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL17P18621 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL17P18621 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL17P18621 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL17P18621 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL17P18621 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL17P18621 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL17P18621 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL17P18621 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL17P18621 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL17P18621 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL17P18621 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL17P18621 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL17P18621 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL17P18621 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL17P18621 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL17P18621 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL17P18621 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL17P18621 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL17P18621 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL17P18621 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL17P18621 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL17P18621 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL17P18621 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL17P18621 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL17P18621 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL17P18621 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL17P18621 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL17P18621 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL17P18621 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL17P18621 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL17P18621 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL17P18621 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL17P18621 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL17P18621 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL17P18621 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL17P18621 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL17P18621 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL17P18621 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL17P18621 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL17P18621 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL17P18621 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL17P18621 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL17P18621 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL17P18621 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL17P18621 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL17P18621 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL17P18621 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL17P18621 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL17P18621 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL17P18621 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL17P18621 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL17P18621 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL17P18621 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL17P18621 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL17P18621 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL17P18621 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL17P18621 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL17P18621 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPL17P18621 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPL17P18621 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPL17P18621 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPL17P18621 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPL17P18621 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL17P18621 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms