Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN1P18031 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN1P18031 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN1P18031 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms