Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNB2P17787 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNB2P17787 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB2P17787 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB2P17787 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB2P17787 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB2P17787 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB2P17787 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB2P17787 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB2P17787 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB2P17787 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB2P17787 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNB2P17787 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNB2P17787 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNB2P17787 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB2P17787 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB2P17787 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB2P17787 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB2P17787 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB2P17787 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB2P17787 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB2P17787 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms