Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BMP4P12644 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BMP4P12644 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP4P12644 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP4P12644 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP4P12644 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP4P12644 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP4P12644 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP4P12644 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP4P12644 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP4P12644 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP4P12644 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP4P12644 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP4P12644 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP4P12644 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP4P12644 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP4P12644 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP4P12644 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP4P12644 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP4P12644 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP4P12644 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP4P12644 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP4P12644 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP4P12644 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP4P12644 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP4P12644 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP4P12644 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP4P12644 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP4P12644 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP4P12644 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP4P12644 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP4P12644 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP4P12644 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP4P12644 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP4P12644 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP4P12644 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP4P12644 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP4P12644 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP4P12644 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP4P12644 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP4P12644 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP4P12644 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BMP4P12644 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BMP4P12644 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP4P12644 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP4P12644 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP4P12644 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP4P12644 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP4P12644 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP4P12644 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP4P12644 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP4P12644 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP4P12644 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP4P12644 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP4P12644 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP4P12644 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP4P12644 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP4P12644 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP4P12644 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP4P12644 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP4P12644 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP4P12644 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP4P12644 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP4P12644 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP4P12644 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP4P12644 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP4P12644 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP4P12644 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP4P12644 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP4P12644 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP4P12644 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP4P12644 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP4P12644 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMP4P12644 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP4P12644 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP4P12644 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP4P12644 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP4P12644 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP4P12644 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP4P12644 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP4P12644 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP4P12644 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP4P12644 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BMP4P12644 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP4P12644 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP4P12644 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP4P12644 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP4P12644 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP4P12644 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMP4P12644 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP4P12644 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP4P12644 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP4P12644 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP4P12644 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BMP4P12644 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP4P12644 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP4P12644 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP4P12644 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP4P12644 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP4P12644 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms