Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA6AP0CW24 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA6AP0CW24 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA6AP0CW24 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA6AP0CW24 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA6AP0CW24 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA6AP0CW24 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PNMA6AP0CW24 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNMA6AP0CW24 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms