Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPN2P04844 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPN2P04844 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPN2P04844 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPN2P04844 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPN2P04844 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPN2P04844 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPN2P04844 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPN2P04844 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPN2P04844 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPN2P04844 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPN2P04844 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPN2P04844 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPN2P04844 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPN2P04844 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPN2P04844 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPN2P04844 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPN2P04844 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPN2P04844 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPN2P04844 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPN2P04844 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPN2P04844 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPN2P04844 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPN2P04844 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPN2P04844 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPN2P04844 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPN2P04844 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPN2P04844 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPN2P04844 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPN2P04844 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPN2P04844 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPN2P04844 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPN2P04844 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPN2P04844 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPN2P04844 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPN2P04844 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPN2P04844 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPN2P04844 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPN2P04844 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPN2P04844 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPN2P04844 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPN2P04844 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPN2P04844 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPN2P04844 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPN2P04844 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPN2P04844 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPN2P04844 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPN2P04844 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPN2P04844 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPN2P04844 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPN2P04844 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPN2P04844 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPN2P04844 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPN2P04844 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPN2P04844 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPN2P04844 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPN2P04844 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPN2P04844 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPN2P04844 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPN2P04844 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPN2P04844 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPN2P04844 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPN2P04844 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPN2P04844 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPN2P04844 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPN2P04844 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RPN2P04844 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPN2P04844 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPN2P04844 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPN2P04844 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPN2P04844 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPN2P04844 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPN2P04844 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPN2P04844 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPN2P04844 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPN2P04844 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPN2P04844 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPN2P04844 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPN2P04844 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPN2P04844 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPN2P04844 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPN2P04844 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPN2P04844 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPN2P04844 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPN2P04844 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPN2P04844 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPN2P04844 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN2P04844 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN2P04844 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN2P04844 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN2P04844 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN2P04844 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN2P04844 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN2P04844 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN2P04844 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN2P04844 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN2P04844 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN2P04844 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN2P04844 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN2P04844 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms