Protein–RNA interactions for Protein: P02708

CHRNA1, Acetylcholine receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA1P02708 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA1P02708 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA1P02708 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA1P02708 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA1P02708 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA1P02708 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA1P02708 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA1P02708 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA1P02708 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA1P02708 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA1P02708 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms