Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APOEP02649 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
APOEP02649 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOEP02649 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOEP02649 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOEP02649 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOEP02649 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOEP02649 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOEP02649 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOEP02649 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOEP02649 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOEP02649 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOEP02649 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOEP02649 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOEP02649 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APOEP02649 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOEP02649 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOEP02649 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOEP02649 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOEP02649 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOEP02649 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOEP02649 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOEP02649 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOEP02649 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOEP02649 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOEP02649 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOEP02649 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOEP02649 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOEP02649 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOEP02649 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
APOEP02649 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOEP02649 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOEP02649 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOEP02649 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOEP02649 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOEP02649 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOEP02649 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOEP02649 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOEP02649 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOEP02649 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOEP02649 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOEP02649 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOEP02649 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOEP02649 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOEP02649 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOEP02649 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOEP02649 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOEP02649 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOEP02649 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOEP02649 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOEP02649 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
APOEP02649 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOEP02649 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOEP02649 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOEP02649 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOEP02649 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOEP02649 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOEP02649 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOEP02649 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOEP02649 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APOEP02649 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOEP02649 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOEP02649 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOEP02649 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOEP02649 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOEP02649 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOEP02649 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOEP02649 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOEP02649 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOEP02649 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOEP02649 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOEP02649 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOEP02649 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOEP02649 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOEP02649 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOEP02649 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APOEP02649 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APOEP02649 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOEP02649 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APOEP02649 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOEP02649 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOEP02649 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOEP02649 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOEP02649 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOEP02649 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOEP02649 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOEP02649 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOEP02649 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOEP02649 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOEP02649 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOEP02649 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOEP02649 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOEP02649 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOEP02649 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOEP02649 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOEP02649 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOEP02649 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOEP02649 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
APOEP02649 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOEP02649 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms