Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNC2P02585 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNC2P02585 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNC2P02585 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms