Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX6O95503 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX6O95503 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX6O95503 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX6O95503 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX6O95503 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX6O95503 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX6O95503 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX6O95503 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX6O95503 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX6O95503 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX6O95503 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX6O95503 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX6O95503 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX6O95503 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX6O95503 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX6O95503 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX6O95503 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX6O95503 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX6O95503 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX6O95503 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX6O95503 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX6O95503 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX6O95503 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX6O95503 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX6O95503 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX6O95503 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX6O95503 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX6O95503 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX6O95503 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX6O95503 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX6O95503 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX6O95503 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX6O95503 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX6O95503 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX6O95503 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX6O95503 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX6O95503 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX6O95503 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX6O95503 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX6O95503 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX6O95503 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX6O95503 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX6O95503 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX6O95503 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX6O95503 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX6O95503 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX6O95503 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX6O95503 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CBX6O95503 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX6O95503 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX6O95503 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX6O95503 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX6O95503 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX6O95503 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CBX6O95503 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX6O95503 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX6O95503 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX6O95503 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX6O95503 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX6O95503 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX6O95503 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX6O95503 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX6O95503 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX6O95503 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX6O95503 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX6O95503 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX6O95503 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX6O95503 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX6O95503 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX6O95503 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX6O95503 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX6O95503 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX6O95503 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX6O95503 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX6O95503 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX6O95503 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX6O95503 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX6O95503 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX6O95503 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX6O95503 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX6O95503 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX6O95503 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX6O95503 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX6O95503 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX6O95503 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms