Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTDNEP1O95476 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTDNEP1O95476 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1O95476 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms