Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FLOT1O75955 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FLOT1O75955 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FLOT1O75955 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FLOT1O75955 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FLOT1O75955 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FLOT1O75955 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FLOT1O75955 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLOT1O75955 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLOT1O75955 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms