Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFPL2O75678 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFPL2O75678 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFPL2O75678 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms