Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM1O75626 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM1O75626 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRDM1O75626 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms