Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TULP3O75386 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TULP3O75386 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TULP3O75386 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP3O75386 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP3O75386 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP3O75386 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP3O75386 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TULP3O75386 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP3O75386 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP3O75386 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP3O75386 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP3O75386 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP3O75386 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP3O75386 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP3O75386 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP3O75386 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP3O75386 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TULP3O75386 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP3O75386 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP3O75386 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP3O75386 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP3O75386 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP3O75386 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP3O75386 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TULP3O75386 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP3O75386 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP3O75386 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP3O75386 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP3O75386 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TULP3O75386 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TULP3O75386 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TULP3O75386 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TULP3O75386 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TULP3O75386 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TULP3O75386 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TULP3O75386 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TULP3O75386 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TULP3O75386 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TULP3O75386 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TULP3O75386 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TULP3O75386 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TULP3O75386 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TULP3O75386 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TULP3O75386 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TULP3O75386 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TULP3O75386 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TULP3O75386 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TULP3O75386 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TULP3O75386 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TULP3O75386 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TULP3O75386 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TULP3O75386 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TULP3O75386 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TULP3O75386 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TULP3O75386 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TULP3O75386 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP3O75386 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP3O75386 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP3O75386 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP3O75386 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP3O75386 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP3O75386 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TULP3O75386 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP3O75386 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP3O75386 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TULP3O75386 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP3O75386 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP3O75386 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP3O75386 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP3O75386 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP3O75386 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP3O75386 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP3O75386 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP3O75386 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP3O75386 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP3O75386 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP3O75386 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TULP3O75386 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TULP3O75386 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TULP3O75386 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TULP3O75386 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TULP3O75386 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TULP3O75386 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TULP3O75386 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP3O75386 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP3O75386 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP3O75386 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP3O75386 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP3O75386 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP3O75386 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP3O75386 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP3O75386 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP3O75386 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TULP3O75386 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP3O75386 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP3O75386 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP3O75386 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP3O75386 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP3O75386 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms