Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH16O75309 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH16O75309 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH16O75309 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH16O75309 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH16O75309 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH16O75309 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH16O75309 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH16O75309 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH16O75309 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH16O75309 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH16O75309 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH16O75309 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH16O75309 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH16O75309 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH16O75309 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH16O75309 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH16O75309 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH16O75309 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH16O75309 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH16O75309 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH16O75309 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH16O75309 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH16O75309 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH16O75309 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH16O75309 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH16O75309 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH16O75309 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH16O75309 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH16O75309 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH16O75309 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH16O75309 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH16O75309 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH16O75309 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH16O75309 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH16O75309 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH16O75309 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH16O75309 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH16O75309 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH16O75309 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH16O75309 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH16O75309 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH16O75309 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH16O75309 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH16O75309 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH16O75309 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH16O75309 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH16O75309 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH16O75309 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH16O75309 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH16O75309 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH16O75309 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH16O75309 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH16O75309 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH16O75309 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH16O75309 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH16O75309 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH16O75309 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH16O75309 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH16O75309 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH16O75309 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH16O75309 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH16O75309 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH16O75309 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH16O75309 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH16O75309 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH16O75309 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH16O75309 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH16O75309 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH16O75309 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH16O75309 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH16O75309 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH16O75309 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH16O75309 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH16O75309 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH16O75309 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH16O75309 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH16O75309 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH16O75309 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH16O75309 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH16O75309 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH16O75309 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH16O75309 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH16O75309 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH16O75309 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH16O75309 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH16O75309 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH16O75309 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH16O75309 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH16O75309 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH16O75309 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH16O75309 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH16O75309 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH16O75309 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH16O75309 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH16O75309 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH16O75309 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH16O75309 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH16O75309 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH16O75309 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms