Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SELENOFO60613 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SELENOFO60613 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SELENOFO60613 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SELENOFO60613 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms