Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5O60239 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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