Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMAD6O43541 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD6O43541 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms