Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP8B1O43520 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP8B1O43520 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms