Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRTM2O43300 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRTM2O43300 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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