Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms