Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF113AO15541 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF113AO15541 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RNF113AO15541 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF113AO15541 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF113AO15541 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF113AO15541 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF113AO15541 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF113AO15541 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF113AO15541 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF113AO15541 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF113AO15541 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF113AO15541 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF113AO15541 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms